【作 者】：网站采编
【关键词】：
【摘 要】：文章目录 1 材料与方法 1.1 试验材料 1.2 绵羊背部皮肤石蜡组织切片及HE染色 1.3 绵羊背部皮肤组织转录组测序 1.4 绵羊背部皮肤组织转录组测序数据分析 1.5 差异表达基因实时荧光定量

文章目录

1 材料与方法

1.1 试验材料

1.2 绵羊背部皮肤石蜡组织切片及HE染色

1.3 绵羊背部皮肤组织转录组测序

1.4 绵羊背部皮肤组织转录组测序数据分析

1.5 差异表达基因实时荧光定量PCR验证

    1.5.1 引物的设计与合成

    1.5.2 荧光定量PCR

2 结 果

2.1 藏羊背部皮肤中立毛肌的形态发生及发育

2.2 藏羊背部皮肤组织转录组测序质量分析

2.3 藏羊背部皮肤组织转录组数据差异基因表达分析

2.4 差异表达基因的GO和KEGG富集分析

2.5 RT-qPCR验证

2.6 调控立毛肌发生的候选基因筛选

3 讨 论

4 结 论

文章摘要:旨在探究调控藏羊皮肤内立毛肌发生的分子机制,挖掘影响立毛肌发生的关键基因。本研究采集了30个75～110日龄健康情况良好的藏羊胚胎,收集背部皮肤组织,制作石蜡组织切片,利用HE染色观察背部皮肤内不同日龄立毛肌的形态学变化特征,推测出立毛肌发生的关键时期为胚龄75～85天(E75～E85);分别挑选胚龄大约在75和85天各3个背部皮肤组织样品,分样品提取RNA,利用Illumina Hiseq平台进行转录组测序,对测序数据进行质控、过滤、比对,筛选得到差异表达基因,并对差异基因进行功能注释、富集分析、蛋白网络互作和RT-qPCR验证,挖掘调控立毛肌早期发育的关键候选基因。测序结果共得到1 159个差异表达的基因(P<0.05),其中900个基因上调,259个基因下调。随机选择6个差异表达的基因进行RT-qPCR验证,表达趋势与转录组测序结果一致,表明测序结果可靠。通过对差异基因进行GO功能注释和KEGG富集分析,筛选到与立毛肌发育相关的5个生物学过程条目和5个信号通路共47个非冗余基因(如BAMBI、TNNI3、HOXA9等)。本研究表明,藏羊立毛肌开始发育的关键时期约为E75～E85天,该时期内SPP1、BAMBI、TNNI3、HOXA9、SOX15可能为影响藏羊立毛肌发生的关键候选基因。

文章关键词:藏羊,立毛肌,转录组,皮肤,

项目基金:国家自然科学基金(31972548),

论文作者:楚金雨 李绍梅 杨戈 牟春燕 

论文分类号: S826.2

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文章来源：《解剖科学进展》 网址: http://www.jpkxjz.cn/qikandaodu/2021/0823/835.html